Siden introduktionen i 1970'erne har mikrobiel analyse gennemgået en kontinuerlig udvikling og forbedring. Oprindeligt blev det hovedsageligt brugt til påvisning af miljøprøver, og senere gradvist udvidet til områderne medicin, landbrug, bioteknik osv. Med bioteknologiens fortsatte fremskridt er mikrobiel analyse løbende blevet fornyet og forbedret, hvilket er blevet en vigtig analytisk metode .
